Hierfür haben wir unser Methodenspektrum erweitert und untersuchen pro Individuum mehr als 50 loci, um so die phylodemographische Auflösung zu erhöhen.
Dabei bedienen wir uns eines kombinierten Verfahrens aus Multiplex PCR und next generation sequencing.
www.uni-mainz.deFor this purpose we have extended our range of methods and analyse more than 50 loci per individual in order to increase the phylodemographic resolution.
We use a protocol combining Multiplex PCR and next generation sequencing.
www.uni-mainz.deProf. Dr. Dr. Heike Allgayer
1a ) Transkriptomanalyse ( next generation sequencing ) der RNA von Tumor- und Normalgewebe eines Patienten mit kolorektalem Karzinom.
1b ) Metastasierungsassay des Hühnereis ( CAM-Assay ):
www.dkfz.deProf. Heike Allgayer MD PhD
1a ) Next generation sequencing and transcriptome analysis of total RNA from tumor and normal tissue of a colorectal cancer patient ( UCSC Genome Browser ).
1b ) Chicken chorioallantoic membrane ( CAM ) assay:
www.dkfz.deEin Schwerpunkt der Forschungsarbeiten im vergangenen Berichtszeitraum lag in der Untersuchung dieses genetischen Locus in Mensch und Maus.
Mit Hilfe der uns zur Verfügung stehenden next generation sequencing Plattform (454 GS-FLX) wurden ABCG5 und ABCG8 in Mensch und Maus komplett sequenziert.
Für die Sequenzierung in der Maus wurden genetisches Material der 3 Mausstämme C57BL/6, BALB/c und FVB verwendet.
www.ngfn.deOne major focus of our work was related to comparative and functional studies of a genetic locus of atherosclerosis predisposition and sterol metabolism at ABCG5 / 8 in mice and men.
We used next generation sequencing (454-GS FLX) for complete resequencing of ABCG5 und ABCG8 in mice and men.
For the resequencing of mice we used DNA from 3 different inbred strains (C57BL/6, BALB/c and FVB) where the locus was previously identified.
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