L'affectation des professeurs de chaire supérieure n'étant pas de compétence rectorale mais ministérielle, les actes administratifs des professeurs de chaire supérieure relèvent entièrement du ministre de l’Éducation nationale.
Les formations donnent lieu à la délivrance de diplômes, majoritairement dans le cadre de conventions avec les universités publiques, et dans un nombre restreint de cas, en jury rectoral.